Met name bij inkomens uit deeltijdarbeid die hoger liggen dan 10.000 gulden, verrekent de werkgever de korting automatisch in zijn geheel met de loonbelasting. Dat is niet bij iedere medewerker bekend, zodat deze ook zelf de heffingskorting heeft aangevraagd. De belastingsdienst gaat er in dat geval vanuit dat de aanvrager niet over een inkomen beschikt en betaalt de korting rechtstreeks uit. Dit bedrag zal dan in 2002 moeten worden terugbetaald